CellNOptR

DOI:10.18129 / B9.bioc.CellNOptR

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见CellNOptR．

利用先验知识网络和摄动数据训练信号网络布尔逻辑模型

Bioconductor版本:3.8

该包基于先前的知识网络和一组数据扰动网络中的节点，对信号通路的布尔逻辑网络进行优化。

作者:T.Cokelaer, F.Eduati, A.MacNamara, S.Schrier, C.Terfve

维护者:A.Gabor

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CellNOptR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CellNOptR”)

PDF		CellNOptR0_1flowchart.pdf
PDF		Fig2.pdf
PDF		Fig3.pdf
PDF		Fig4.pdf
PDF		Fig6.pdf
PDF		Fig7.pdf
PDF		Fig8.pdf
PDF	R脚本	主要插图:使用CellNOptR玩网络
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学，CellBasedAssays，CellBiology，ImmunoOncology，蛋白质组学，软件，TimeCourse
版本	1.28.1
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(7.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.15.0)，RBGL，图、方法、哈希，RCurl，Rgraphviz，XML，ggplot2
进口
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，igraph，stringi，stringr
SystemRequirements	Graphviz版本>= 2.2
增强了
URL
全靠我	CNORdt，CNORfeeder，CNORfuzzy，CNORode
进口我
建议我	MEIGOR
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	CellNOptR_1.28.1.tar.gz
Windows二进制	CellNOptR_1.28.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	CellNOptR_1.28.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellNOptR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CellNOptR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CellNOptR/
软件包下载报告	下载数据