该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅compgo。
生物导体版本:3.8
该软件包包含完成多个任务的功能。它能够从UCSC下载完整的基因组数据库,轻松地导入文件,以上述数据库转储的基因(加距离)的基因(加距离)注释这些.bed文件区域,与David接口以创建功能注释和基因本体学富集图表,并根据基因列表列表(例如从输入.bed文件生成的),最后使用有向的无环形图或散点图可视化和比较这些富集。
作者:Sam D. Bassett [AUT],Ashley J. Waardenberg [AUT,CRE]
维护者:Ashley J. Waardenberg
引用(从r内,输入引用(“ compgo”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ compgo”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ compgo”)
R脚本 | 介绍 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 去,,,,基因烯,,,,多重组合,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | rdavidwebservice |
进口 | rtracklayer,,,,rgraphviz,,,,GGPLOT2,,,,GenomicFeatures,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9,,,,pcamethods,,,,RESHAPE2,,,,PathView |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | compgo_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | compgo_1.18.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | compgo_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compgo |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/compgo |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/compgo/ |
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