解读

DOI:10.18129 / B9.bioc.DECIPHER

该软件包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见解读．

用于管理、分析和操纵生物序列的工具

Bioconductor版本:3.8

用于破译和管理生物序列的工具集。

作者:埃里克·赖特

维护者:Erik Wright

安装

要安装这个包，启动R(版本"3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DECIPHER")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“破译”)

PDF	R脚本	序列进行分类
PDF	R脚本	设计群体特定的FISH探针
PDF	R脚本	设计特定群体的引物
PDF	R脚本	设计微阵列探针
PDF	R脚本	设计引物，产生组特定的签名
PDF	R脚本	寻找嵌合序列
PDF	R脚本	开始解密
PDF	R脚本	R中多序列对齐的艺术
PDF		参考手册

细节

biocViews	对齐，聚类，DataImport，遗传学，ImmunoOncology，微阵列，微生物组，质量控制，测序，软件，可视化，WholeGenome，qPCR
版本	2.10.2
在Bioconductor中	BioC 2.9 (R-2.14)(7.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3.0)，Biostrings(> = 2.35.12),RSQLite(>= 1.1)， stats, parallel
进口	方法,DBI，S4Vectors，IRanges，XVector
链接	Biostrings，S4Vectors，IRanges，XVector
建议
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	AssessORF
进口我	AssessORFData，metagenomeFeatures，openPrimeR
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	DECIPHER_2.10.2.tar.gz
Windows二进制	DECIPHER_2.10.2.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	DECIPHER_2.10.2.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/DECIPHER
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/DECIPHER
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DECIPHER/
软件包下载报告	下载数据