剂量
doi：10.18129/b9.bioc.dos
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅剂量。
疾病本体论语义和富集分析
生物导体版本：3.8
该软件包分别实现了Resnik，Schlicker，Jiang，Lin和Wang提出的五种方法，用于测量DO术语和基因产品之间的语义相似性。还实施了包括高几何模型和基因集富集分析在内的富集分析，以发现高通量生物学数据的疾病关联。
作者：广琴Yu [AUT，CRE]，Li-Gen Wang [CTB]，Vladislav Petyuk [CTB]，Giovanni Dall'olio [CTB]
维护者：gmail.com> guangchuang yu
引用（从r内，输入引用（“剂量”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ dose”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“剂量”）
| html | R脚本 | 00剂量简介 |
| html | R脚本 | 01剂量语义相似性分析 |
| html | R脚本 | 02疾病富集分析 |
| html | R脚本 | 03疾病GSEA |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，基因烯，，，，多重组合，，，，途径，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 3.8.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（7。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.4.0） |
| 进口 | AnnotationDbi，，，，生物比较，，，，do.db，，，，fgsea，，，，GGPLOT2，，，，Gosemsim（> = 2.0.0），方法，QVALUE，，，，RESHAPE2，，，，S4VECTORS，统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，clusterProfiler，，，，尼特，，，，org.hs.eg.db，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://guangchuangyu.github.io/software/dose |
| BugReports | https://github.com/guangchuangyu/dose/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 生物加工者，，，，clusterProfiler，，，，碎片器，，，，EEGC，，，，富集，，，，面部，，，，gdcrnatools，，，，林，，，，Mageckflute，，，，网眼，，，，mirsponge，，，，MOONLIGHTR，，，，途径图，，，，Reactomepa，，，，rnaseqr |
| 建议我 | Gosemsim |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | dose_3.8.2.tar.gz |
| Windows二进制 | dose_3.8.2.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | dose_3.8.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dose |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/剂量 |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/dose/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
