Doscheda

DOI:10.18129 / B9.bioc.Doscheda

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见Doscheda．

下游化学蛋白质组学分析管道

Bioconductor版本:3.8

Doscheda专注于定量化学蛋白质组学，用于使用质谱数据从全细胞或组织裂解物中确定小分子的蛋白质相互作用谱。该软件包提供了一个闪亮的应用程序来运行管道，几个可视化和一个可下载的实验报告。

作者:Bruno Contrino, Piero Ricchiuto

维护者:Bruno Contrino

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Doscheda”)

超文本标记语言	R脚本	Doscheda
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，ImmunoOncology，MassSpectrometry，归一化，预处理，蛋白质组学，质量控制，回归，软件
版本	1.4.1
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	方法,刚果民主共和国统计数据,httr，jsonlite，reshape2，vsn，affy，limma，stringr，ggplot2，图形，grDevices，校准，corrgram，gridExtra，DT，闪亮的，shinydashboard，readxl，d3heatmap，prodlim，matrixStats
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	Doscheda_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	Doscheda_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Doscheda_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Doscheda
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Doscheda
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Doscheda/
软件包下载报告	下载数据