淋巴索
doi：10.18129/b9.bioc.lymphoseq
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅淋巴索。
分析T和B细胞受体的高通量测序
生物导体版本：3.8
该R包分析了T和B细胞受体互补性的高通量测序确定由自适应生物技术的Immunoseq分析产生的区域3（CDR3）序列。它的输入来自从Immunoseq分析仪导出的TAB分隔值（.TSV）文件。
作者：David Coffey
维护者：David Coffey
引用（从r内，输入引用（“淋巴索”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.5”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ lymphoseq”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“淋巴索”）
| html | R脚本 | 分析用淋巴糖的T和B细胞受体的高通量测序 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 结盟，，，，乘以quessequealignment，，，，测序，，，，软件，，，，目标征服，，，，技术 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（3年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.3），淋巴结杆菌 |
| 进口 | Data.Table，，，，plyr，，，，dplyr，，，，重塑，，，，Venndiagram，，，，GGPLOT2，，，，ineq，，，，rcolorbrewer，，，，循环，网格，utils，统计，格特里，，，，MSA，，，，生物弦，，，，Phangorn，，，，字符串，，，，insctr |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，pheatmap，，，，WordCloud，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Lymphoseq_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Lymphoseq_1.10.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | Lymphoseq_1.10.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lymphoseq |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/淋巴索 |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/lymphoseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
