该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅代谢信号。
生物导体版本:3.8
代谢信号是一个R软件包,允许合并,分析和自定义代谢和信号KEGG途径。它是一种基于网络的方法,旨在探索基因(信号或酶促)和代谢物之间的拓扑关系,代表了研究代谢表型的遗传景观和调节网络的强大工具。
作者:Andrea Rodriguez-Martinez,Rafael Ayala,Joram M. Posma,Ana L. Neves,Maryam Anwar,Jeremy K. Nicholson,Marc-Emmanuel Dumas
维护者:Andrea Rodriguez-Martinez
引用(从r内,输入引用(“代谢信号”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ameposignal”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“代谢信号”)
html | R脚本 | 代谢信号 |
html | R脚本 | 代谢信号2:将KEGG与其他交互资源合并 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因信号,,,,遗传学,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,网络,,,,途径,,,,Reactome,,,,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 3.3) |
进口 | kegggraph,,,,HPAR,,,,Igraph,,,,rcurl,,,,keggrest,,,,ensdb.hsapiens.v75,统计,图形,utils,org.hs.eg.db,,,,Biomart,,,,AnnotationDbi,,,,mwastools,,,,mygene |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物基因,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | MetaBosignal_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | emabosignal_1.12.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | emabosignal_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabosignal |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/amebosignal |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/metabosignal/ |
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