甲基粘合
doi：10.18129/b9.bioc.methylmix
该包适用于生物导体的3.8版；对于稳定的最新版本，请参阅甲基粘合。
甲基粘合：识别甲基化驱动的癌症基因
生物导体版本：3.8
甲基粘合症是一种实施的算法，以鉴定疾病的超甲基化基因和低甲基化基因。甲基粘合基于β混合模型，以鉴定甲基化状态并将其与正常的DNA甲基化状态进行比较。甲基粘合使用新型统计量，差甲基化值或DM值定义为具有正常甲基化态的甲基化状态的差异。最后，匹配的基因表达数据用于通过关注影响基因表达的甲基化变化来识别功能性甲基化状态。参考文献：Gevaert 0.甲基粘合症：用于鉴定DNA甲基化驱动基因的R包装。生物信息学（英格兰牛津）。2015; 31（11）：1839-41。doi：10.1093/bioinformatics/btv020。Gevaert O，Tibshirani R，胸膜炎。使用甲基化的DNA甲基化驱动基因的Pancancer分析。 Genome Biology. 2015;16(1):17. doi:10.1186/s13059-014-0579-8.
作者：Olivier Gevaert
维护者：gmail.com上的Olivier Gevaert
引用（从r内，输入引用（“甲基粘合”））：
安装
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if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“甲基磁”）
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文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“甲基粘合”）
| html | R脚本 | 甲基粘合 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | DNAMETHYLATY，，，，差异性，，，，差甲基化，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，甲基化array，，，，网络，，，，途径，，，，软件，，，，统计信息 |
| 版本 | 2.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（4。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r（> = 3.2.0） |
| 进口 | foreach，，，，rpmm，，，，rcolorbrewer，，，，GGPLOT2，，，，rcurl，，，，算，，，，Data.Table，，，，林玛，，，，r.matlab，，，，消化 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，多帕尔，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | 甲基mix_2.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | 甲基mix_2.12.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | 甲基mix_2.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylmix |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/甲基磁 |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/methylmix/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
