MineICA

DOI:10.18129 / B9.bioc.MineICA

该软件包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见MineICA。

基因组学数据获得的ICA分解分析

Bioconductor版本:3.8

MineICA的目标是对多个转录组数据集进行独立成分分析(ICA)，整合其他数据(如分子、临床和病理)。这种整合的ICA通过研究组分与变量(如样本注释)和基因集的关联来帮助组分的生物学解释，并使用基于相关性的图对来自不同数据集的组分进行比较。

作者:安妮·比顿

维护者:Anne Biton < Anne。Biton在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MineICA")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“MineICA”)

PDF	R脚本	基因组数据的独立成分分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	MultipleComparison，软件，可视化
版本	1.22.0
在Bioconductor中	BioC 2.12 (R-3.0)(6年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.10)， methods;BiocGenerics(> = 0.13.8),Biobase，plyr，ggplot2，尺度，foreach，xtable，biomaRt，gtools，GOstats，集群，marray，mclust，RColorBrewer，色彩，igraph，Rgraphviz，图，注释，Hmisc，fastICA，玉
进口	AnnotationDbi，光民，fpc，lumiHumanAll.db
链接
建议	biomaRt，GOstats，集群，hgu133a.db，mclust，igraph，breastCancerMAINZ，breastCancerTRANSBIG，breastCancerUPP，breastCancerVDX
SystemRequirements
增强了	doMC
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	MineICA_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	MineICA_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MineICA_1.22.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/MineICA
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/MineICA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MineICA/
软件包下载报告	下载数据