ngscopy.

DOI：10.18129 / b9.bioc.ngscopy.

此套餐适用于Biocumonds 3.8版;对于稳定的最新版本版本，请参阅ngscopy.。

NGSCopy：检测下一代测序排序中的拷贝数变型

生物导体版本：3.8

NGSCopy提供了用于检测下一代测序（NGS）的拷贝数变异的定量呼叫者，包括整个基因组测序（WGS），整个外序测序（WES）和靶线测序（TPS）。呼叫者可以通过染色体并行化，以在一台计算机上使用多个处理器/核心。

作者：小叶赵[AUT，CRE，CPH]

维护者：Xiaobei Zhao

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.5”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“ngscopy”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“NGSCOPY”）

PDF.	r script.	NGSCopy：检测下一代测序中的拷贝数变型（用户指南）
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	复印机那dnaseq.那ExoMeSeq.那免疫学那测序那软件那targetedresequencing.那Wholegenome.
版本	1.16.1.
在生物导体中以来	BIOC 3.0（R-3.1）（4.5岁）
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 3.1.0）
进口	方法，平行，XMISC.（> = 0.2.1），RBAMTools（> = 2.6.0），变换点（> = 2.1.1）
链接到
建议	运行那ngscopydata.那Genomicranges.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	ngscopy_1.16.1.tar.gz.
Windows二进制文件	ngscopy_1.16.1.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.11（El Capitan）	ngscopy_1.16.1.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/nycopy.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ ngscopy
包短网址	http://biocidodder.org/packages/nycopy/
包裹下载报告	下载统计信息