ping

doi:10.18129/b9.bioc.ping

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅ping

用基于MNase或超声的短阅读数据对核小体定位的概率推断

生物导体版本:3.8

使用经验贝叶斯混合模型方法对CHIP-SEQ的概率推断。

作者:Xuekui Zhang ,Raphael Gottardo ,sangsoon woo

维护者:renan sauteraud

引用(从r内,输入引用(“ ping”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ping”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ ping”)

PDF R脚本 Ping用户指南
PDF R脚本 使用配对末端测序数据的ping
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 聚类,,,,测序,,,,软件,,,,统计信息,,,,可视化
版本 2.26.0
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(7年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.15.0),chipseq,,,,iranges,,,,基因组机
进口 方法,图片,图形,grdevices,Stats,GVIZ,,,,FDA,,,,BSGENOME,stats4,生物基因,,,,iranges,,,,S4VECTORS
链接
建议 平行,Shortread,,,,rtracklayer
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ping_2.26.0.tar.gz
Windows二进制 ping_2.26.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) ping_2.26.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ping
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/ping
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/ping/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户