该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅rnaprobr。
生物导体版本:3.8
该软件包促进了对下一代测序数据的分析,该数据的位置信息具有单个核苷酸分辨率是关键。它允许在表或UCSC兼容的床上图文件中应用不同类型的相关正常化,数据可视化和导出。
作者:Lukasz Jan Kielpinski [AUT],Nikos Sidiropoulos [Cre,Aut],Jeppe Vinther [aut]
维护者:nikos sidiropoulos
引用(从r内,输入引用(“ rnaprobr”)):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rnaprobr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rnaprobr”)
| R脚本 | RNAPROBR:用于分析基于大规模平行测序的RNA结构探测方法的R包装 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
| 生物浏览 | 覆盖范围,,,,基因数,,,,正常化,,,,测序,,,,软件 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(4年) |
| 执照 | GPL(> = 2) |
| 要看 | r(> = 3.1.1),GenomicFeatures(> = 1.16.3),plyr(> = 1.8.1),生物基因(> = 0.10.0) |
| 进口 | 生物弦(> = 2.32.1),基因组机(> = 1.16.4),iranges(> = 2.10.5),rsamtools(> = 1.16.1),rtracklayer(> = 1.24.2),基因组签名(> = 1.5.12),S4VECTORS(> = 0.14.7),图形,统计,utils |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rnaprobr_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | rnaprobr_1.14.0.zip |
| Mac OS X 10.11(El Capitan) | rnaprobr_1.14.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaprobr |
| 源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rnaprobr |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rnaprobr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |