RankProd

DOI:10.18129 / B9.bioc.RankProd

该软件包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RankProd．

秩积法鉴别差异表达基因及其在meta分析中的应用

Bioconductor版本:3.8

基于错误预测的估计百分比(pfp)识别差异表达(上调或下调)基因的非参数方法。该方法可以结合来自不同来源的数据集(元分析)，以增加识别的能力。

作者:Francesco Del Carratore < Francesco .delcarratore at postgrad.manchester.ac。英国b>，安德里斯·詹凯维奇<安德里斯。jankevics at gmail.com>洪方欣在jimmy.harvard.edu>， Ben Wittner ， Rainer Breitling < Rainer。百年灵在曼彻斯特。Florian Battke < Battke: informatik.uni-tuebingen.de>

维护者:Francesco Del Carratore

安装

要安装这个包，启动R(版本"3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"，悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RankProd")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“RankProd”)

PDF	R脚本	RankProd教程
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，GeneSignaling，Lipidomics，代谢组学，微阵列，蛋白质组学，ResearchField，软件，StatisticalMethod，SystemsBiology
版本	3.8.0
在Bioconductor中	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> - 14年)
许可证	文件许可
取决于	R (>= 3.2.1)， stats, methods，Rmpfr，gmp
进口	图形
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我	RNAither，tRanslatome
进口我	HTSanalyzeR，synlet
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	RankProd_3.8.0.tar.gz
Windows二进制	RankProd_3.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	RankProd_3.8.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/RankProd
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/RankProd
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/RankProd/
软件包下载报告	下载数据