ReQON

DOI:10.18129 / B9.bioc.ReQON

该软件包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ReQON。

重新校准核苷酸的质量

Bioconductor版本:3.8

BAM格式序列数据基本质量分数的再校准算法。

作者:Christopher Cabanski, Keary Cavin, Chris Bizon

维护者:Christopher Cabanski

安装

要安装这个包，启动R(版本"3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ReQON")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“ReQON”)

PDF	R脚本	ReQON教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	HighThroughputSequencing，预处理，质量控制，测序，软件
版本	1.28.0
在Bioconductor中	BioC 2.9 (R-2.14)(7.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.0.2)，Rsamtools，seqbias
进口	rJava，图形，统计，utils, grDevices
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements	Java版本>= 1.6
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	ReQON_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	ReQON_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ReQON_1.28.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/ReQON
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/ReQON
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/ReQON/
软件包下载报告	下载数据