该软件包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本,请参见红色的。
Bioconductor版本:3.8
RedeR是一个基于r语言的包,结合了一个独立的Java应用程序,用于交互式可视化和模块化结构、嵌套网络和多级层次关联的操作。
作者:Mauro Castro, Xin Wang, Florian Markowetz
维护者:毛罗·卡斯特罗<毛罗。卡斯特罗在gmail.com>
引用(来自R,输入引用(“红”)
):
要安装这个包,启动R(版本"3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RedeR")
对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“红”)
超文本标记语言 | R脚本 | RedeR:分层网络表示 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,GraphAndNetwork,基础设施,网络,软件,可视化 |
版本 | 1.30.0 |
在Bioconductor中 | BioC 2.9 (R-2.14)(7.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 3.3.3),方法 |
进口 | igraph |
链接 | |
建议 | pvclust,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | Java运行环境(>= 6) |
增强了 | |
URL | http://genomebiology.com/2012/13/4/R29 |
这取决于我 | Fletcher2013b |
进口我 | Mulder2012,PANR,研制,transcriptogramer |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
源包 | RedeR_1.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | RedeR_1.30.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | RedeR_1.30.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/RedeR |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/RedeR |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/RedeR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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