红色的

DOI:10.18129 / B9.bioc.RedeR

该软件包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本,请参见红色的

嵌套网络的交互式可视化和操作

Bioconductor版本:3.8

RedeR是一个基于r语言的包,结合了一个独立的Java应用程序,用于交互式可视化和模块化结构、嵌套网络和多级层次关联的操作。

作者:Mauro Castro, Xin Wang, Florian Markowetz

维护者:毛罗·卡斯特罗<毛罗。卡斯特罗在gmail.com>

引用(来自R,输入引用(“红”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("RedeR")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“红”)

超文本标记语言 R脚本 RedeR:分层网络表示
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentationGraphAndNetwork基础设施网络软件可视化
版本 1.30.0
在Bioconductor中 BioC 2.9 (R-2.14)(7.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 3.3.3),方法
进口 igraph
链接
建议 pvclustBiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements Java运行环境(>= 6)
增强了
URL http://genomebiology.com/2012/13/4/R29
这取决于我 Fletcher2013b
进口我 Mulder2012PANR研制transcriptogramer
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 RedeR_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 RedeR_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) RedeR_1.30.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/RedeR
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/RedeR
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/RedeR/
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