这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见SAGx.
Bioconductor版本:3.8
用于从Affymetrix基因芯片中检索、准备和分析数据的软件包。特别是鉴别差异表达基因的问题。
作者:Per Broberg
维护者:Per Broberg,
引文(从R内,输入引用(“SAGx”)):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SAGx")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“SAGx”)
| R脚本 | Samroc -示例 | |
| 参考手册 |
| biocViews | 聚类,DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,KEGG,微阵列,MultipleComparison,OneChannel,通路,预处理,回归,软件 |
| 版本 | 1.56.0 |
| 在Bioconductor | BioC 1.9 (R-2.4)(12.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 2.5.0), stats,乘、方法 |
| 进口 | Biobase, stats4 |
| 链接 | |
| 建议 | KEGG.db,hu6800.db,质量 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://home.swipnet.se/pibroberg/expression_hemsida1.html |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | SAGx_1.56.0.tar.gz |
| Windows二进制 | SAGx_1.56.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | SAGx_1.56.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SAGx |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SAGx |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SAGx/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: