SPIA

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPIA

此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见SPIA．

信号通路影响分析(SPIA)使用通路过度表达和不寻常信号扰动的综合证据

Bioconductor版本:3.8

该软件包实现了信号通路影响分析(SPIA)，它使用差异表达基因及其对数折叠变化和信号通路拓扑结构的信息，以确定与研究条件最相关的通路。

作者:Adi Laurentiu Tarca ， Purvesh Kathri < Purvesh at cs.wayne.edu>和Sorin Draghici < Sorin at wayne.edu>

维护人员:Adi Laurentiu Tarca

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager" BiocManager::install("SPIA")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“SPIA”)

PDF	R脚本	SPIA
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	GraphAndNetwork，微阵列，软件
版本	2.34.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (R-2.9)(10年)
许可证	文件许可
取决于	R(>= 2.14.0)，图形，KEGGgraph
进口	图形
链接
建议	图，Rgraphviz，hgu133plus2.db
SystemRequirements
增强了
URL	http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btn577v1
取决于我
进口我	EnrichmentBrowser
建议我	石墨，KEGGgraph
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	SPIA_2.34.0.tar.gz
Windows二进制	SPIA_2.34.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	SPIA_2.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPIA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SPIA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SPIA/
包下载报告	下载数据