STRINGdb

DOI:10.18129 / B9.bioc.STRINGdb

此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见STRINGdb．

交互作用蛋白质数据库检索工具

Bioconductor版本:3.8

STRINGdb包为STRING蛋白质-蛋白质相互作用数据库(http://www.string-db.org)提供了一个R接口。

作者:Andrea Franceschini < Andrea . Franceschini at isb-sib.ch>

维护者:Damian Szklarczyk < Damian。Szklarczyk在imls.uzh.ch>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.5”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("STRINGdb")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“STRINGdb”)

PDF	R脚本	STRINGdb装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	网络，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor公司	BioC 2.13 (R-3.0)(5.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.14.0)
进口	png，sqldf，plyr，igraph，RCurl、方法、RColorBrewer，gplots，哈希，plotrix
链接
建议	RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	PPInfer，scsR
进口我	coexnet，glmSparseNet，IMMAN，pwOmics，日坛，XINA
建议我	epiNEM，GeneNetworkBuilder，netSmooth，PCAN
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	STRINGdb_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	STRINGdb_1.22.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	STRINGdb_1.22.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/STRINGdb
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/STRINGdb
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/STRINGdb/
软件包下载报告	下载数据