彩带

DOI:10.18129 / B9.bioc.Streamer

此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见彩带．

支持大文件的流处理

Bioconductor版本:3.8

在R中处理大型数据文件可能比较困难，因为数据通常位于内存中。这个包鼓励一种编程风格，即数据通过“生产者”和一系列“消费者”从磁盘“流”到R，通常将原始数据减少到可管理的大小。该包为数据输入、采样、索引和转换等操作提供了有用的Producer和Consumer流组件;看到包吗?彩带for details.

作者:Martin Morgan, Nishant Gopalakrishnan

维护者:马丁·摩根<马丁。摩根在roswellpark.org >

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.5”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Streamer")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“流光”)

PDF	R脚本	Streamer:一个简单的例子
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，基础设施，软件
版本	1.28.1
Bioconductor自	BioC 2.9 (R-2.14)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	方法,图，RBGL平行,BiocGenerics
链接
建议	RUnit，Rsamtools(> = 1.5.53),GenomicAlignments，Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	plethy
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	Streamer_1.28.1.tar.gz
Windows二进制	Streamer_1.28.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Streamer_1.28.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Streamer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/拖缆
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Streamer/
包下载报告	下载数据