TCseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.TCseq

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见TCseq

时间序列数据分析

Bioconductor版本:3.8

表观基因组和转录组时间序列数据的定量和差异分析,时间序列数据的时间模式的聚类分析和可视化。

作者:Mengjun Wu , Lei Gu

维护者:Mengjun Wu

引文(从R内,输入引用(“TCseq”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("TCseq")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TCseq”)

PDF R脚本 TCseq装饰图案
PDF 参考手册

细节

biocViews ChIPSeq聚类DifferentialExpression表观遗传学ImmunoOncologyRNASeq测序软件TimeCourse可视化
版本 1.6.1
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(2年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.4)
进口 刨边机BiocGenericsreshape2GenomicRangesIRangesSummarizedExperimentGenomicAlignmentsRsamtoolse1071集群ggplot2,网格,grDevices,统计,utils,方法,locfit
链接
建议 testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 TCseq_1.6.1.tar.gz
Windows二进制 TCseq_1.6.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) TCseq_1.6.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TCseq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TCseq
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/TCseq/
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