TxRegInfra

DOI:10.18129 / B9.bioc.TxRegInfra

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见TxRegInfra

转录调控网络多组规范的元数据管理

Bioconductor版本:3.8

这个包提供了用于监管网络创建的基因组元数据的接口,重点是noSQL解决方案。目前,eqtl、DnaseI超敏位点和数字基因组足迹的定量表示是使用raggeexperimental API的内存外扩展组装的。

作者:文斯·凯里

维护者:VJ Carey

引文(从R内,输入引用(“TxRegInfra”)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("TxRegInfra")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TxRegInfra”)

超文本标记语言 R脚本 TxRegInfra——TxRegQuery的类和方法
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 网络软件
版本 1.2.1 "
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(一年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 RaggedExperiment(> = 1.3.11),mongolite
进口 方法,rjsonGenomicRangesIRangesBiocParallelGenomeInfoDbS4VectorsSummarizedExperiment,跑龙套
链接
建议 knitrGenomicFilesEnsDb.Hsapiens.v75testthatbiovizBase(> = 1.27.2),GvizAnnotationFilterensembldb
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 TxRegInfra_1.2.1.tar.gz
Windows二进制 TxRegInfra_1.2.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) TxRegInfra_1.2.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TxRegInfra
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TxRegInfra
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/TxRegInfra/
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