该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅affxparser。
生物导体版本:3.8
用于解析Affymetrix文件的包(CDF,CEL,CHP,BPMAP,BAR)。它提供了使用AffyMetrix'Fusion SDK快速和有效解析Affymetrix文件的方法。支持ASCII和二进制文件。当前,有一些读取芯片定义文件(CDF)和单元强度文件(CEL)的方法。这些文件可以完全或部分读取。例如,可以从几个探针中的探针信号从一组CEL文件中非常快地提取到方便的列表结构中。
作者:Henrik Bengtsson [AUT],James Bullard [AUT],Robert Gentleman [CTB],Kasper Daniel Hansen [Aut,Cre],Jim Hester [CTB],Martin Morgan [CTB]
维护者:gmail.com上的Kasper Daniel Hansen
引用(从r内,输入引用(“ affxparser”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ affxparser”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,基础设施,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,专有Platratforms,,,,软件 |
版本 | 1.54.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.7(R-2.2)(13。5年) |
执照 | LGPL(> = 2) |
要看 | R(> = 2.14.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | R.OO(> = 1.22.0),r.utils(> = 2.7.0),AffymetrixDatatestFiles |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/henrikbengtsson/affxparser |
BugReports | https://github.com/henrikbengtsson/affxparser/issues |
取决于我 | 斜体,,,,pdinfobuilder,,,,rmat,,,,斯塔尔 |
进口我 | Affyilm,,,,CN.Farms,,,,杂交,,,,EventPointer,,,,Generegionscan,,,,斜体,,,,奥利戈,,,,rmat |
建议我 | 锡 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | affxparser_1.54.0.tar.gz |
Windows二进制 | affxparser_1.54.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | affxparser_1.54.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affxparser |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/affxparser |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/affxparser/ |
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