affxparser

doi:10.18129/b9.bioc.affxparser

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅affxparser

Affymetrix文件解析SDK

生物导体版本:3.8

用于解析Affymetrix文件的包(CDF,CEL,CHP,BPMAP,BAR)。它提供了使用AffyMetrix'Fusion SDK快速和有效解析Affymetrix文件的方法。支持ASCII和二进制文件。当前,有一些读取芯片定义文件(CDF)和单元强度文件(CEL)的方法。这些文件可以完全或部分读取。例如,可以从几个探针中的探针信号从一组CEL文件中非常快地提取到方便的列表结构中。

作者:Henrik Bengtsson [AUT],James Bullard [AUT],Robert Gentleman [CTB],Kasper Daniel Hansen [Aut,Cre],Jim Hester [CTB],Martin Morgan [CTB]

维护者:gmail.com上的Kasper Daniel Hansen

引用(从r内,输入引用(“ affxparser”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ affxparser”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,基础设施,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,专有Platratforms,,,,软件
版本 1.54.0
在生物导体中 Bioc 1.7(R-2.2)(13。5年)
执照 LGPL(> = 2)
要看 R(> = 2.14.0)
进口
链接
建议 R.OO(> = 1.22.0),r.utils(> = 2.7.0),AffymetrixDatatestFiles
系统要求
增强
URL https://github.com/henrikbengtsson/affxparser
BugReports https://github.com/henrikbengtsson/affxparser/issues
取决于我 斜体,,,,pdinfobuilder,,,,rmat,,,,斯塔尔
进口我 Affyilm,,,,CN.Farms,,,,杂交,,,,EventPointer,,,,Generegionscan,,,,斜体,,,,奥利戈,,,,rmat
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 affxparser_1.54.0.tar.gz
Windows二进制 affxparser_1.54.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) affxparser_1.54.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affxparser
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/affxparser
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/affxparser/
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