bioassayR

DOI:10.18129 / B9.bioc.bioassayR

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见bioassayR．

小分子生物活性的交叉靶标分析

Bioconductor版本:3.8

bioassayR是一种计算工具，可以同时分析在不同的化合物和生物靶标上进行的数千个生物测定实验。独特的功能包括支持公共和自定义生物分析的大规模跨目标分析，生成高通量筛选指纹(htsfp)，以及可选的预装数据库，可访问大量公开可用的生物活性数据。

作者:Tyler Backman, Ronly Schlenk, Thomas Girke

维护者:Tyler Backman

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("bioassayR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“bioassayR”)

超文本标记语言	R脚本	简介及例子
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学，CellBasedAssays，DataImport，ImmunoOncology，基础设施，代谢组学，MicrotitrePlateAssay，蛋白质组学，软件，可视化
版本	1.20.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.1.0)，DBI(> = 0.3.1),RSQLite(>= 1.0.0)，矩阵，rjson，BiocGenerics(> = 0.13.8)
进口	XML，ChemmineR
链接
建议	BiocStyle，RCurl，biomaRt，cellHTS2，knitr，knitcitations，knitrBootstrap，testthat，ggplot2，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/TylerBackman/bioassayR
BugReports	https://github.com/TylerBackman/bioassayR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	bioassayR_1.20.1.tar.gz
Windows二进制	bioassayR_1.20.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	bioassayR_1.20.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bioassayR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bioassayR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/bioassayR/
软件包下载报告	下载数据