生物签名

doi:10.18129/b9.bioc.biosigner

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅生物签名

从OMICS数据发现的签名发现

生物导体版本:3.8

特征选择在OMICS数据分析中至关重要,可以从复杂和高维数据中提取受限和有意义的分子特征,并构建强大的分类器。该软件包实现了一种新方法,以评估变量与分类器的预测性能的相关性。该方法可以与PLS-DA,随机森林和SVM二元分类器并行运行。返回签名和相应的“限制”模型,从而在新数据集上进行未来的预测。该软件包的星系实现可用于计算代谢组学的WorkFlow4Metabolomics.org在线基础架构。

作者:philippe rinaudo ,etienne thevenot

维护者:philippe rinaudo ,etienne thevenot

引用(从r内,输入引用(“生物签名”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ BioSigner”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“生物签名”)

html R脚本 小插图标题
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,特征提取,,,,脂质组学,,,,代谢组学,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,转录组学
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(3年)
执照 塞西尔
要看
进口 方法,E1071,,,,Randomforest,,,,ropls,,,,生物酶
链接
建议 生物标志,,,,运行,,,,生物基因,,,,生物使用,,,,golubeset,,,,Hu6800.db,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 BioSigner_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 BioSigner_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) BioSigner_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biosigner
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/生物签名者
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/biosigner/
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