这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见cbaf.
Bioconductor版本:3.8
该软件包包含的功能可以方便地分析和比较来自不同癌症/癌症亚群的各种基因组。到目前为止,它与存储在cbioportal.org上的RNA-seq, microRNA-seq,微阵列和甲基化数据集兼容。
作者:Arman Shahrisa [aut, cre, cph], Maryam Tahmasebi Birgani [aut]
维护者:Arman Shahrisa < Shahrisa。Arman在hotmail.com>
引文(从R内,输入引用(“cbaf”)
):
要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cbaf")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“cbaf”)
超文本标记语言 | R脚本 | cbaf |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件,技术 |
版本 | 1.4.1 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | BiocFileCache,RColorBrewer,cgdsr,genefilter,gplots, grDevices, stats, utils,xlsx |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | cbaf_1.4.1.tar.gz |
Windows二进制 | cbaf_1.4.1.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | cbaf_1.4.1.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cbaf |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cbaf |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/cbaf/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: