derfinderplot

doi:10.18129/b9.bioc.derfinderplot

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅derfinderplot

DERFINDER的绘图功能

生物导体版本:3.8

该软件包为Derfinder软件包的结果提供了绘图功能。

作者:Leonardo Collado-Torres [AUT,CRE],Andrew E. Jaffe [AUT],Jeffrey T. Leek [Aut,THS]

维护者:leonardo collado-torres

引用(从r内,输入引用(“ derfinderplot”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ derfinderplot”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ derfinderplot”)

html R脚本 DERFINDERPLOT简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,可视化
版本 1.16.1
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.2)
进口 德芬德(> = 1.1.0),GenomeInfodB(> = 1.3.3),GenomicFeatures,,,,基因组机(> = 1.17.40),GGBIO(> = 1.13.13),GGPLOT2,图形,grdevices,iranges(> = 1.99.28),林玛, 方法,plyr,,,,rcolorbrewer,,,,Refmanager,,,,RESHAPE2,,,,S4VECTORS(> = 0.9.38),,UTILS
链接
建议 Biovizbase(> = 1.27.2),Bumphunter(> = 1.7.6),derfinderdata(> = 0.99.0),SessionInfo,,,,编织(> = 1.0.1),尼特(> = 1.6),生物使用(> = 2.5.19),org.hs.eg.db,,,,rmarkDown(> = 0.3.3),测试,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL https://github.com/leekgroup/derfinderplot
BugReports https://support.bioconductor.org/t/derfinderplot
取决于我
进口我 recountworkflow
建议我 德芬德,,,,地区报告
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 derfinderplot_1.16.1.tar.gz
Windows二进制 derfinderplot_1.16.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) derfinderplot_1.16.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/derfinderplot
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/derfinderplot
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/derfinderplot/
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