diffuStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.diffuStats

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见diffuStats．

生物网络上的扩散分数

Bioconductor版本:3.8

标签传播方法是计算生物学中广泛使用的程序，用于使用网络数据为分子实体提供上下文。节点标签可以来自基因表达、全基因组关联研究、蛋白质结构域或代谢组学分析，它们被传播到网络中的邻居，通过事先注释的知识有效地平滑分数，并优先考虑新的候选对象。R包diffuStats包含一组扩散内核和便于计算和基准测试的评分方法。

作者:Sergio Picart-Armada和Alexandre Perera-Lluna

维护者:Sergio Picart-Armada

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("diffuStats")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“diffuStats”)

PDF	R脚本	案例研究:预测蛋白质功能
超文本标记语言	R脚本	快速启动
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GraphAndNetwork，网络，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.4)
进口	grDevices, stats, methods，矩阵，质量，expm，igraph，Rcpp，RcppArmadillo，RcppParallel，plyr，precrec
链接	Rcpp，RcppArmadillo，RcppParallel
建议	testthat，knitr，rmarkdown，ggplot2，ggsci，igraphdata，BiocStyle，reshape2
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	diffuStats_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	diffuStats_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	diffuStats_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/diffuStats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/diffuStats
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/diffuStats/
软件包下载报告	下载数据