enrichplot

DOI:10.18129 / B9.bioc.enrichplot

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见enrichplot．

功能丰富结果的可视化

Bioconductor版本:3.8

“enrichment plot”包实现了几种可视化方法，用于解释从ORA或GSEA分析中获得的功能富集结果。所有的可视化方法都是基于'ggplot2'图形开发的。

作者:于广创[aut, cre]

维护人员:guangchuangyu

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" enrichment plot")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“enrichplot”)

超文本标记语言	R脚本	enrichplot介绍
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释，去，GeneSetEnrichment，KEGG，通路，软件，可视化
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(一年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	AnnotationDbi，cowplot，剂量(> = 3.5.1),europepmc，ggplot2，ggplotify，ggraph，ggridges，GOSemSim，图形，grDevices，网格，gridExtra，igraph、方法、purrr，RColorBrewer，reshape2统计数据,UpSetR,跑龙套
链接
建议	clusterProfiler，knitr，org.Hs.eg.db，prettydoc
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/GuangchuangYu/enrichplot
BugReports	https://github.com/GuangchuangYu/enrichplot/issues
全靠我
进口我	ChIPseeker，clusterProfiler，debrowser，网格，ReactomePA
建议我	methylGSA
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	enrichplot_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	enrichplot_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	enrichplot_1.2.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enrichplot
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/富贵
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/enrichplot/
软件包下载报告	下载数据