拖鞋

DOI：10.18129 / b9.bioc.flipflop.

此套餐适用于Biocumonds 3.8版;对于稳定的最新版本版本，请参阅拖鞋。

基于快速的套索的同种型预测作为流量问题

生物导体版本：3.8

根据RNA-SEQ读取数据，Flipflop发现基因的同种型与它们的丰度一起在给定的样品中表达。它以SAM格式占据了一个对齐文件作为输入。它还可以同时发现来自几个样品的转录物，增加统计功率。

作者：elsa伯纳德，劳伦·雅各布，朱利安Mairal和Jean-Philippe Vert

维护者：Elsa Bernard

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.5”）并输入：

if（！qualocmanespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“flipflop”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“FLIPFLOP”）

PDF.	r script.	Flipflop：基于快速的套索的同种型预测作为流量问题
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	替代品那rnaseq.那rnaseqdata.那回归那软件
版本	1.20.0
在生物导体中以来	BIOC 2.13（R-3.0）（5.5岁）
执照	GPL-3.
依靠	r（> = 2.10.0）
进口	方法，矩阵那绞喉那Genomicranges.， 平行
链接到
建议	基因组法
系统要求	GNU制作
加强
URL.	http://cbio.ensmp.fr/flipflop.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	flipflop_1.20.0.tar.gz.
Windows二进制文件	flipflop_1.20.0.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.11（El Capitan）	flipflop_1.20.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/flipflop.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/触发器
包短网址	http://biocidodder.org/packages/flipflop/
包裹下载报告	下载统计信息