fmcsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.fmcsR

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见fmcsR．

错配容忍度最大公共子结构搜索

Bioconductor版本:3.8

fmcsR包引入了一种高效的最大公共子结构(MCS)算法，结合了一种新颖的匹配策略，允许两个小分子共享的子结构中的原子和/或键不匹配。由此产生的柔性MCSs (FMCSs)通常比严格的MCSs更大，从而在其源结构中识别更多的共同特征，以及在寻找结构相似性较弱的化合物时具有更高的灵敏度。fmcsR包提供了几个实用程序来使用FMCS算法进行成对复合比较、结构相似性搜索和聚类。

作者:王燕，泰勒·贝克曼，凯文·霍兰，托马斯·格克

维护者:Thomas Girke < Thomas。Girke在ucr.edu>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("fmcsR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“fmcsR”)

超文本标记语言	R脚本	fmcsR
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，CellBasedAssays，Cheminformatics，聚类，DataImport，基础设施，代谢组学，MicrotitrePlateAssay，遗传药理学，药物基因组学，蛋白质组学，软件，可视化
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.10.0)，ChemmineR、方法
进口	RUnit、方法、ChemmineR，BiocGenerics、并行
链接
建议	BiocStyle，knitr，knitcitations，knitrBootstrap
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/girke-lab/fmcsR
全靠我
进口我	Rcpi
建议我	ChemmineR
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	fmcsR_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	fmcsR_1.24.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	fmcsR_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fmcsR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/fmcsR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/fmcsR/
软件包下载报告	下载数据