gesper

doi:10.18129/b9.bioc.gesper

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅gesper

基因特异性表型估计量

生物导体版本:3.8

估计来自脱靶混杂的RNAi屏幕的基因特异性表型。每个siRNA的表型都是基于靶向和不靶向基因的基因建模的。

作者:Fabian Schmich

维护者:Fabian Schmich

引用(从r内,输入引用(“ Gesper”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gesper”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Gesper”)

PDF R脚本 一个用于脱衣舞脱靶混杂的RNAi屏幕的R套件
PDF 参考手册

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,遗传学,,,,免疫学,,,,预处理,,,,回归,,,,软件,,,,可视化
版本 1.14.1
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(4年)
执照 GPL-3
要看 方法,图形,GGPLOT2,R(> = 2.10)
进口 矩阵,,,,Glmnet,,,,CellHTS2,,,,生物酶,,,,Biomart,,,,多帕尔, 平行,foreach,,,,RESHAPE2,,,,dplyr
链接
建议 尼特
系统要求
增强
URL http://www.cbg.ethz.ch/software/gesper
取决于我
进口我 EIR
建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gesper_1.14.1.tar.gz
Windows二进制 gesper_1.14.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) gesper_1.14.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gesper
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/gesper
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/gesper/
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