goseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.goseq

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅goseq。

基因本体论分析器RNA-seq和其他长度偏差数据

Bioconductor版本:3.8

检测基因本体和/或其他用户定义的类别/ /在RNA-seq表示数据

作者:马修年轻

维护人员:Nadia戴维森<纳迪亚。戴维森在mcri.edu.au >,安东尼·霍金斯<安东尼。霍金斯在mcri.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“goseq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“goseq”)

PDF	R脚本	goseq用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	去,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,转录
版本	1.34.1
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(9年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.11.0),BiasedUrn,geneLenDataBase(> = 1.9.2)
进口	mgcv、图表、数据、跑龙套,AnnotationDbi,GO.db,BiocGenerics
链接
建议	刨边机,org.Hs.eg.db,rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	rgsepd
进口我	冠军,理想的,PathwaySplice,击杀
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	goseq_1.34.1.tar.gz
Windows二进制	goseq_1.34.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	goseq_1.34.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/goseq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ goseq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/goseq/
包下载报告	下载数据