iasva

DOI:10.18129 / B9.bioc.iasva

此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见iasva．

迭代调整代理变量分析

Bioconductor版本:3.8

迭代调整替代变量分析(ia - va)是一个统计框架，用来发现隐藏的变化来源，即使这些来源是相关的。IA-SVA提供了一种灵活的方法:i)在调整所有已知因素的同时，识别不必要的异质性的隐藏因素;Ii)检验假设的隐藏因素对解释数据中未建模的变化的显著性;和iii)，如果重要，使用估计的因素作为下一个迭代中的一个额外的已知因素，以发现进一步的隐藏因素。

作者:李东亨[aut, cre]， Anthony Cheng [aut]， Nathan Lawlor [aut]， Duygu Ucar [aut]

维护者:Donghyung Lee ， Anthony Cheng

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.5”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("iasva")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“iasva”)

超文本标记语言	R脚本	检测单细胞RNA-Seq数据中的隐藏异质性
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect，FeatureExtraction，ImmunoOncology，预处理，质量控制，RNASeq，软件，StatisticalMethod
版本	1.0.1
在Bioconductor公司	BioC 3.8 (R-3.5)(0.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5)
进口	irlba统计数据,集群、图形、SummarizedExperiment，BiocParallel
链接
建议	knitr，testthat，rmarkdown，股东价值分析，Rtsne，pheatmap，corrplot，DescTools，RColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	iasva_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	iasva_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	iasva_1.0.1.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iasva
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/iasva
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/iasva/
软件包下载报告	下载数据