netReg

DOI:10.18129 / B9.bioc.netReg

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见netReg．

网络正则化回归模型

Bioconductor版本:3.8

netReg使用网络惩罚拟合线性回归模型。图先验知识，以生物网络的形式，被纳入线性模型的损失函数。这些网络描述了生物学关系，如同一转录因子/代谢物的共同调节或依赖性等。给出了系数剖面的部分稀疏解和部分光滑解。

作者:Simon Dirmeier [aut, cre]

维护者:Simon Dirmeier < Simon。Dirmeier在web.de>

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("netReg")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“netReg”)

超文本标记语言	R脚本	netReg
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	FeatureExtraction，GraphAndNetwork，网络，回归，软件，StatisticalMethod
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(2年)
许可证	GPL-3 | BSL-1.0 +文件LICENSE
取决于	R (>= 3.4)
进口	Rcpp,统计数据
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，lintr，lassoshooting
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/dirmeier/netReg
BugReports	https://github.com/dirmeier/netReg/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	netReg_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	netReg_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	netReg_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/netReg
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/netReg
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/netReg/
软件包下载报告	下载数据