omicRexposome

DOI:10.18129 / B9.bioc.omicRexposome

这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅omicRexposome。

Exposome和使数据协会和集成分析

Bioconductor版本:3.8

omicRexposome目前常用曝光和使数据之间的关联评价,利用MultiDataSet协调数据管理、rexposome exposome数据定义和limma协会测试。也执行数据集成混合exposome和使用多co-inherent使数据分析(omicade4)和multi-canonical相关分析(PMA)。

作者:Carles Hernandez-Ferrer (aut (cre),胡安·r·冈萨雷斯(aut)

维护人员:Carles Hernandez-Ferrer <卡莱斯。埃尔南德斯在isglobal.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“omicRexposome”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“omicRexposome”)

HTML	R脚本	使数据Exposome数据集成
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,DifferentialMethylation,表观遗传学,GeneExpression,GeneRegulation,ImmunoOncology,MultipleComparison,蛋白质组学,回归,软件,StatisticalMethod,转录组,可视化,WorkflowStep
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(1.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可
取决于	R (> = 3.4),Biobase
进口	属性,跑龙套,grDevices、图形的方法,rexposome,limma,股东价值分析,ggplot2,ggrepel,PMA,omicade4,gridExtra,MultiDataSet,SmartSVA,isva平行,SummarizedExperiment,stringr
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,snpStats,brgedata
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	omicRexposome_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	omicRexposome_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	omicRexposome_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicRexposome
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ omicRexposome
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/omicRexposome/
包下载报告	下载数据