openCyto

DOI:10.18129 / B9.bioc.openCyto

此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见openCyto．

流式细胞术数据分层门控管道

Bioconductor版本:3.8

这个包的设计是为了方便自动门控方法以顺序的方式模拟手动门控策略。

作者:Mike Jiang, John Ramey, Greg Finak, Raphael Gottardo

维护者:Mike Jiang

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“openCyto”)

超文本标记语言	R脚本	openCyto包的介绍
超文本标记语言	R脚本	如何使用不同的自动门控功能
超文本标记语言	R脚本	如何编写csv门控模板
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，FlowCytometry，ImmunoOncology，预处理，软件
版本	1.20.2
在Bioconductor公司	BioC 2.13 (R-3.0)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	flowWorkspace(> = 3.17.43)
进口	方法,Biobase，BiocGenerics，gtools，flowCore(> = 1.31.17),flowViz，ncdfFlow(> = 2.11.34),flowWorkspace，flowStats(> = 3.29.1),flowClust(> = 3.11.4),质量，线索，plyr，RBGL，图，data.table，ks，RColorBrewer，晶格，rrcov，R.utils
链接	Rcpp
建议	flowWorkspaceData，knitr，testthat， utils, tools, parallel，ggcyto
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	CytoML
建议我	flowCore，ggcyto
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	openCyto_1.20.2.tar.gz
Windows二进制	openCyto_1.20.2.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	openCyto_1.20.2.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/openCyto
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/openCyto
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/openCyto/
软件包下载报告	下载数据