oppar

DOI:10.18129 / B9.bioc.oppar

此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见oppar．

R

Bioconductor版本:3.8

Wang等人(2012)发表的mCOPA包的R实施。Oppar提供了癌症离群数据分析的方法。尽管最初开发的目的是在癌症研究中检测离群基因，oppar中提出的方法一般可用于离群谱分析。此外，为基因集富集和通路分析提供了工具。

作者:王宸玮[aut]， Alperen Taciroglu [aut]， Stefan R Maetschke [aut]， Colleen C Nelson [aut]， Mark Ragan [aut]， Melissa Davis [aut]， Soroor Hediyeh zadeh [cre]， Momeneh Foroutan [ctr]

维护者:Soroor Hediyeh zadeh

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.5”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“oppar”)

超文本标记语言	R脚本	OPPAR: R
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneSetEnrichment，通路，软件，SystemsBiology
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.3)
进口	Biobase、方法、GSEABase，GSVA
链接
建议	knitr，rmarkdown，limma，org.Hs.eg.db，GO.db，雪、并行
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	oppar_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	oppar_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	oppar_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/oppar
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ oppar
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/oppar/
包下载报告	下载数据