pathprint

DOI:10.18129 / B9.bioc.pathprint

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本，请参见pathprint．

基因表达阵列分析的通路指纹

Bioconductor版本:3.8

将作为表达表或GEO引用提供的基因表达数组转换为“通路指纹”的算法，“通路指纹”是一组通路中表示高(1)、低(-1)或不重要(0)表达的离散三元分数向量。

作者:Gabriel Altschuler, Sokratis Kariotis

维护者:Sokratis Kariotis

安装

要安装这个包，启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“pathprint”)

PDF	R脚本	pathprint
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，KEGG，Reactome，软件，转录
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(2年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 3.4)
进口	统计,跑龙套
链接
建议	所有，GEOquery，pathprintGEOData，SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	pathprintGEOData
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	pathprint_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	pathprint_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	pathprint_1.12.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathprint
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pathprint
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pathprint/
软件包下载报告	下载数据