PBCMC

doi:10.18129/b9.bioc.pbcmc

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

此软件包适用于生物导体的3.8版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅PBCMC

分子分类的基于置换的信心

生物导体版本:3.8

PBCMC软件包表征了基因表达分类器的不确定性评估,a。k。一个。分子特征,基于置换测试。为了实现这一目标,合成模拟受试者是通过基因标签的排列获得的。然后,针对相应的亚型分类器测试每个合成主体以构建无效分布。因此,可以为每个受试者提供分类置信度测量,以帮助医师治疗选择。目前,它仅适用于GenEfu软件包中的PAM50实现,但可以很容易地扩展到其他分子特征。

作者:Cristobal Fresno,German A. Gonzalez,Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez

维护者:gmail.com上的cristobal fresno

引用(从r内,输入引用(“ PBCMC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pbcmc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 分类,,,,聚类,,,,差异性,,,,基因表达,,,,kegg,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,正常化,,,,Onechannel,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件,,,,两通道,,,,Mrnamicroarray
版本 1.10.1
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(3年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.4),Genefu
进口 生物酶,,,,生物基因,,,,生物比较(> = 1.3.13),并行,RESHAPE2,网格,utils,牛仔图, 方法,林玛,,,,GGPLOT2,,,,栅格,grdevices,统计
链接
建议 乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌
系统要求
增强
URL http://www.bdmg.com.ar/
取决于我
进口我
建议我 Migsa
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pbcmc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pbcmc
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pbcmc/
软件包下载报告 下载统计

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