这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。
此软件包适用于生物导体的3.8版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅PBCMC。
生物导体版本:3.8
PBCMC软件包表征了基因表达分类器的不确定性评估,a。k。一个。分子特征,基于置换测试。为了实现这一目标,合成模拟受试者是通过基因标签的排列获得的。然后,针对相应的亚型分类器测试每个合成主体以构建无效分布。因此,可以为每个受试者提供分类置信度测量,以帮助医师治疗选择。目前,它仅适用于GenEfu软件包中的PAM50实现,但可以很容易地扩展到其他分子特征。
作者:Cristobal Fresno,German A. Gonzalez,Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez
维护者:gmail.com上的cristobal fresno
引用(从r内,输入引用(“ PBCMC”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pbcmc”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | 分类,,,,聚类,,,,差异性,,,,基因表达,,,,kegg,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,正常化,,,,Onechannel,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件,,,,两通道,,,,Mrnamicroarray |
版本 | 1.10.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(3年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.4),Genefu |
进口 | 生物酶,,,,生物基因,,,,生物比较(> = 1.3.13),并行,RESHAPE2,网格,utils,牛仔图, 方法,林玛,,,,GGPLOT2,,,,栅格,grdevices,统计 |
链接 | |
建议 | 乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://www.bdmg.com.ar/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | Migsa |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pbcmc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/pbcmc |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/pbcmc/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |