PCAGOPOMOTER

doi:10.18129/b9.bioc.pcagoPomoter

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅PCAGOPOMOTER

PCAGOPOMOTER用于分析DNA微阵列数据

生物导体版本:3.8

该软件包包含功能以简化DNA微阵列的分析。它利用主成分分析作为最初的多元分析,然后利用过度代表分析对主要成分维度进行功能解释,对GO术语和调节解释过度代表分析,并使用对Primo算法的预测转录因子结合位点的过度代表分析分析。

作者:莫滕·汉森(Morten Hansen),乔根·奥尔森(Jorgen Olsen)

维护者:莫滕·汉森(Morten Hansen)

引用(从r内,输入引用(“ PCAGOPOMOTER”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pcagopromoter”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ pcagoPomoter”)

PDF R脚本 PCAGOPOMOTER
PDF 参考手册

细节

生物浏览 ,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,软件,,,,可视化
版本 1.26.0
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(7年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 2.14.0),椭圆,,,,生物弦
进口 AnnotationDbi
链接
建议 rgraphviz,,,,go.db,,,,hgu133plus2.db,,,,鼠标4302.DB,,,,RAT2302.DB,,,,hugene10sttranscriptcluster.db,,,,mogene10sttranscriptcluster.db,,,,pcagopromoter.hs.hg19,,,,pcagoPomoter.mm.mm9,,,,PCAGOPROMOTER.RN.RN4,,,,血清刺激, 平行
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 PCAGOPROMOTER_1.26.0.TAR.GZ
Windows二进制 PCAGOPROMOTER_1.26.0.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) PCAGOPROMOTER_1.26.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcagopromoter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pcagoPomoter
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pcagopromoter/
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