该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅PCAGOPOMOTER。
生物导体版本:3.8
该软件包包含功能以简化DNA微阵列的分析。它利用主成分分析作为最初的多元分析,然后利用过度代表分析对主要成分维度进行功能解释,对GO术语和调节解释过度代表分析,并使用对Primo算法的预测转录因子结合位点的过度代表分析分析。
作者:莫滕·汉森(Morten Hansen),乔根·奥尔森(Jorgen Olsen)
维护者:莫滕·汉森(Morten Hansen)
引用(从r内,输入引用(“ PCAGOPOMOTER”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pcagopromoter”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ pcagoPomoter”)
R脚本 | PCAGOPOMOTER | |
参考手册 |
生物浏览 | 去,,,,基因表达,,,,微阵列,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.26.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.10(R-2.15)(7年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.14.0),椭圆,,,,生物弦 |
进口 | AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | rgraphviz,,,,go.db,,,,hgu133plus2.db,,,,鼠标4302.DB,,,,RAT2302.DB,,,,hugene10sttranscriptcluster.db,,,,mogene10sttranscriptcluster.db,,,,pcagopromoter.hs.hg19,,,,pcagoPomoter.mm.mm9,,,,PCAGOPROMOTER.RN.RN4,,,,血清刺激, 平行 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | PCAGOPROMOTER_1.26.0.TAR.GZ |
Windows二进制 | PCAGOPROMOTER_1.26.0.ZIP |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | PCAGOPROMOTER_1.26.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcagopromoter |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/pcagoPomoter |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/pcagopromoter/ |
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