pcaMethods

DOI:10.18129 / B9.bioc.pcaMethods

此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见pcaMethods．

PCA方法的集合

Bioconductor版本:3.8

提供贝叶斯PCA，概率PCA, Nipals PCA，逆非线性PCA和传统的SVD PCA。采用基于聚类的缺失值估计方法进行比较。BPCA、PPCA和NipalsPCA可用于对不完整数据进行PCA，以及对缺失值进行准确估计。还提供了一组打印和绘制结果的方法。所有的PCA方法都使用相同的数据结构(pcaRes)为PCA结果提供公共接口。由德国Golm的Max-Planck分子植物生理学研究所发起。

作者:Wolfram Stacklies, Henning Redestig, Kevin Wright

维护者:Henning Redestig < Henning。红色在gmail.com >

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.5”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("pcaMethods")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“pcaMethods”)

PDF	R脚本	数据与异常值
PDF	R脚本	简介
PDF	R脚本	缺失值归责
PDF		参考手册

细节

biocViews	贝叶斯，软件
版本	1.74.0
Bioconductor自	BioC 1.9 (R-2.4)(12.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	Biobase、方法
进口	BiocGenerics，Rcpp(> = 0.11.3),质量
链接	Rcpp
建议	matrixStats，晶格，ggplot2
SystemRequirements	Rcpp
增强了
URL	https://github.com/hredestig/pcamethods
BugReports	https://github.com/hredestig/pcamethods/issues
取决于我	DeconRNASeq
进口我	CompGO，consensusDE，DAPAR，MSnbase，先驱者，PanVizGenerator，scde，SomaticSignatures
建议我	mtbls2
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	pcaMethods_1.74.0.tar.gz
Windows二进制	pcaMethods_1.74.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	pcaMethods_1.74.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcaMethods
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pcaMethods
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/pcaMethods/
包下载报告	下载数据