pvca

DOI:10.18129 / B9.bioc.pvca

这个包适用于Bioconductor 3.8版;有关稳定的最新发布版本,请参见pvca

主方差成分分析(PVCA)

Bioconductor版本:3.8

该包包含通过将所有“源”拟合为随机效应,包括混合模型中的双向相互作用项(依赖于lme4包)来评估批处理源的功能,这些主成分是从原始数据相关矩阵中获得的。此包随书“微阵列实验中的批处理效应和噪声,第12章。

作者:Pierre Bushel < Bushel at niehs.nih.gov>

维护者:Jianying LI

引文(从R内,输入引用(pvca)):

安装

要安装这个包,启动R (version "3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("pvca")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (pvca)

PDF R脚本 微阵列数据的批效应估计
PDF 参考手册

细节

biocViews BatchEffect微阵列软件
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(6年)
许可证 LGPL (>= 2.0)
取决于 R (>= 2.15.1)
进口 矩阵Biobasevsn统计数据,lme4
链接
建议 golubEsets
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 ExpressionNormalizationWorkflow
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 pvca_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 pvca_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) pvca_1.22.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pvca
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pvca
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/pvca/
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