该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅rmat。
生物导体版本:3.8
该软件包是包装垫的R版本,包含解析和合并Affymetrix bpmap和Cel瓷砖阵列文件(使用基于C ++的Fusion SDK和BioConductor软件包AFFXPARSER),使用序列特定模型从chip- chip- andect-flocect-芯片实验。注意:用户应安装GSL和GenomeGraphs。Windows用户:“请查阅源分布的Inst目录中可用的REDME文件,以获取必要的配置指令。Snow Leopard用户可以通过Grand Central Dispatch利用速度提高!
作者:Charles Cheung和Arnaud Droit和Raphael Gottardo
维护者:Arnaud droit
引用(从r内,输入引用(“ rmat”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rmat”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ rmat”)
R脚本 | RMAT用户指南 | |
参考手册 |
生物浏览 | 微阵列,,,,预处理,,,,软件 |
版本 | 3.32.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.4(R-2.9)(10年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.9.0),生物基因(> = 0.1.3),iranges(> = 1.13.10),生物酶(> = 2.15.1),affxparser |
进口 | 统计,方法,生物基因,,,,iranges,,,,生物酶,,,,affxparser,Stats4 |
链接 | |
建议 | 基因组,,,,rtracklayer |
系统要求 | GSL(GNU科学库) |
增强 | |
URL | http://www.rglab.org |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rmat_3.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | rmat_3.32.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rmat |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rmat |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rmat/ |
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