rSFFreader

DOI:10.18129 / B9.bioc.rSFFreader

该软件包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见rSFFreader。

rSFFreader读取由Roche 454和Life Sciences Ion Torrent测序仪生成的sff文件

Bioconductor版本:3.8

rSFFreader从Roche 454和Life Sciences Ion Torrent测序器生成的sff文件中读取序列，质量和剪辑点值，这些文件与fastq文件相似。

作者:Matt Settles ， Sam Hunter, Brice Sarver, Ilia Zhbannikov, kyyu - chul Cho

维护者:Matt Settles

安装

要安装这个包，启动R(版本"3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("rSFFreader")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“rSFFreader”)

PDF	R脚本	rSFFreader的介绍
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，测序，软件
版本	0.30.0
在Bioconductor中	BioC 2.11 (R-2.15)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	ShortRead(> = 1.23.17)
进口	方法,Biostrings，IRanges
链接	S4Vectors(> = 0.13.8),IRanges，XVector，Biostrings
建议	xtable
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我	hiReadsProcessor
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	rSFFreader_0.30.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	rSFFreader_0.30.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/rSFFreader
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/rSFFreader
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rSFFreader/
软件包下载报告	下载数据