- 家
- Bioconductor 3.8
- 软件包
- rnaseqcomp
rnaseqcomp
DOI:10.18129 / B9.bioc.rnaseqcomp
这个包是3.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rnaseqcomp。
RNA-seq量化的标准管道
Bioconductor版本:3.8
一些定量和可视化RNA-seq量化的标准管道。双态量化基因、成绩单、连接或外显子由每个管道应提供必要的元信息组织成数字矩阵以进行评估。
作者:Mingxiang腾和拉斐尔·a·伊
维护人员:Mingxiang腾< tengmx gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“rnaseqcomp”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.5”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rnaseqcomp”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“rnaseqcomp”)
| R脚本 | rnaseqcomp用户指南 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 质量控制,RNASeq,软件,可视化 |
| 版本 | 1.12.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.2.0) |
| 进口 | RColorBrewer、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/tengmx/rnaseqcomp |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | SummarizedBenchmark |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | rnaseqcomp_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | rnaseqcomp_1.12.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | rnaseqcomp_1.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaseqcomp |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rnaseqcomp |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/rnaseqcomp/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
