seqlogo

doi:10.18129/b9.bioc.seqlogo

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅seqlogo

DNA序列比对的序列徽标

生物导体版本:3.8

Seqlogo采用DNA序列基序的位置权重矩阵,并绘制Schneider和Stephens(1990)引入的相应序列徽标。

作者:Oliver Bembom

维护者:oliver bembom

引用(从r内,输入引用(“ seqlogo”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ seqlogo”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ seqlogo”)

PDF R脚本 DNA序列比对的序列徽标
PDF 参考手册

细节

生物浏览 测序,,,,软件
版本 1.48.0
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(12年)
执照 LGPL(> = 2)
要看 方法,网格
进口 Stats4
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我 结肠管制,,,,主题,,,,rgadem
进口我 兴趣,,,,主题,,,,pwmenrich,,,,rgadem,,,,riboseqr,,,,剪接物,,,,碎片,,,,TFBSTOOLS
建议我 Bcrank,,,,difflogo,,,,logolas,,,,主题,,,,Universalmotif
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 seqlogo_1.48.0.tar.gz
Windows二进制 seqlogo_1.48.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) seqlogo_1.48.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqlogo
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqlogo
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/seqlogo/
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