该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅seqlogo。
生物导体版本:3.8
Seqlogo采用DNA序列基序的位置权重矩阵,并绘制Schneider和Stephens(1990)引入的相应序列徽标。
作者:Oliver Bembom
维护者:oliver bembom
引用(从r内,输入引用(“ seqlogo”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ seqlogo”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ seqlogo”)
R脚本 | DNA序列比对的序列徽标 | |
参考手册 |
生物浏览 | 测序,,,,软件 |
版本 | 1.48.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.0(R-2.5)(12年) |
执照 | LGPL(> = 2) |
要看 | 方法,网格 |
进口 | Stats4 |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 结肠管制,,,,主题,,,,rgadem |
进口我 | 兴趣,,,,主题,,,,pwmenrich,,,,rgadem,,,,riboseqr,,,,剪接物,,,,碎片,,,,TFBSTOOLS |
建议我 | Bcrank,,,,difflogo,,,,logolas,,,,主题,,,,Universalmotif |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | seqlogo_1.48.0.tar.gz |
Windows二进制 | seqlogo_1.48.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | seqlogo_1.48.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqlogo |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqlogo |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/seqlogo/ |
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