该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅三人组。
生物导体版本:3.8
测试SNP和SNP与基因型TDT的相互作用。此软件包还包含用于计算LD度量的成对值和识别LD块的函数,以及用于设置匹配的病例的伪伪基因型基因型数据,以便运行三重奏逻辑回归,以便运行三重奏逻辑回归,以插入丢失的基因型中的基因型。三重奏,用于模拟与SNP相互作用的疾病风险以及三重奏数据中的功率和样本计算的疾病风险。
作者:Holger Schwender,Qing Li,Philipp Berger,Christoph Neumann,Margaret Taub,Ingo Ruczinski
维护者:Holger Schwender
引用(从r内,输入引用(“三重奏”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ trio”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“三重奏”)
R脚本 | 三人逻辑回归和基因型TDT | |
参考手册 |
生物浏览 | 遗传因素,,,,遗传学,,,,微阵列,,,,SNP,,,,软件 |
版本 | 3.20.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(5。5年) |
执照 | LGPL-2 |
要看 | R(> = 3.0.1) |
进口 | |
链接 | |
建议 | 生存,,,,haplo.stats,,,,McBiopi,,,,siggenes,花键,逻辑(> = 1.5.3),逻辑(> = 1.28.1),克恩斯门茶,,,,变体 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | trio_3.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | trio_3.20.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | trio_3.20.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trio |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/三人组 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/trio/ |
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