在这里,我们报告了基于支持向量机(SVM)模型和芯片序列数据的计算过程,以确定整个基因组识别顺式调节元素所需的组蛋白标记的最佳数量。该方法首先定义了用于预测调节元素的最佳组蛋白修饰集,然后使用此最佳集合来识别增强器。SVM模型已在公共可用的9种不同细胞系的公共芯片seq数据以及从Encode(http://genome.ucsc.edu/encode)和Gene Expression Omnibus(GSE26230)中获得的8种组蛋白修饰进行了设计,训练和测试。Copyright --------- Installation ------------ This package should be installed using the `R CMD INSTALL' mechanism, see the R online help or R manuals for details on how to安装软件包。