此包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DuoClustering2018.
Bioconductor版本:3.8
预处理的实验和模拟scRNA-seq数据集,用于评估Duò等人(2018)对scRNA-seq数据的聚类方法。还包含对每个数据集应用几种聚类方法的结果,以及绘制方法性能的函数。
作者:安吉洛Duò,夏洛特·索尼森
维护者:Angelo Duò < Angelo。两人在icloud.com >
引用(从R中,输入引用(“DuoClustering2018”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.5”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("十二指肠集群2018")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“DuoClustering2018”)
超文本标记语言 | R脚本 | 应用聚类方法 |
超文本标记语言 | R脚本 | 情节表现总结 |
超文本标记语言 | R脚本 | 使用iSEE可视化数据集和聚类结果 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,SingleCellData |
版本 | 1.0.0 |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | ExperimentHub跑龙套,magrittr,dplyr,tidyr,mclust,ggplot2,purrr,reshape2,冬青,ggthemes、统计数据、方法 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,iSEE,嘘,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,plyr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | DuoClustering2018_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DuoClustering2018 |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DuoClustering2018 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DuoClustering2018/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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