该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅ngscopydata。
生物导体版本:3.8
人肺肿瘤的BAM文件子集,并通过靶向面板测序汇总正常样品。[Zhao等,2014年。使用北卡罗来纳大学(UNC)测序测定法捕获了NSCLC中最先前描述的遗传像差的非小细胞肺癌(NSCLC)的靶向测序。在准备中。]每个样本是从原始测序数据中得出的10%随机子样本。汇总的正常样品已重新缩放到“池”中普通样品总数。这里提供的是CHR6(HG19)上的亚采样数据。
作者:小佐比[AUT,CRE,CPH]
维护者:xiaobei zhao
引用(从r内,输入引用(“ ngscopydata”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ngscopydata”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
参考手册 |
生物浏览 | 癌症,,,,实验数据,,,,Lungcancerdata,,,,序列数据 |
版本 | 1.2.0 |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.andersvercelli.com/packages/release/data/experiment/html/ngscopydata.html |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | ngscopy |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ngscopydata_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ngscopydata |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ngscopydata |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/ngscopydata/ |
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