ngscopydata

doi:10.18129/b9.bioc.ngscopydata

该包适用于生物导体的3.8版;对于稳定的最新版本,请参阅ngscopydata

NGScopy软件包的人类肿瘤和汇总正常测序数据的BAM文件子集(Zhao等人,2014年)

生物导体版本:3.8

人肺肿瘤的BAM文件子集,并通过靶向面板测序汇总正常样品。[Zhao等,2014年。使用北卡罗来纳大学(UNC)测序测定法捕获了NSCLC中最先前描述的遗传像差的非小细胞肺癌(NSCLC)的靶向测序。在准备中。]每个样本是从原始测序数据中得出的10%随机子样本。汇总的正常样品已重新缩放到“池”中普通样品总数。这里提供的是CHR6(HG19)上的亚采样数据。

作者:小佐比[AUT,CRE,CPH]

维护者:xiaobei zhao

引用(从r内,输入引用(“ ngscopydata”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.5”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ngscopydata”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 癌症,,,,实验数据,,,,Lungcancerdata,,,,序列数据
版本 1.2.0
执照 GPL(> = 2)
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URL //www.andersvercelli.com/packages/release/data/experiment/html/ngscopydata.html
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源包 ngscopydata_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ngscopydata
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ngscopydata
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/ngscopydata/
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